土壤消毒剂可分为：农药性和微生物制剂性杀菌剂，农药性的杀菌剂是具有高毒性、内吸性和传导性等特点，例如：溴甲烷，氰氨化钙等；选用无残留，高效的过氧乙酸消毒剂，二氧化氯消毒剂因其具有杀菌性强，有无毒、环保和高效等特点，所以必将成为今后土壤消毒的发展方向。
由于重茬种植，根结线虫等土传病害已成影响棚室蔬菜生产较为突出的问题，在大棚空闲期进行土壤消毒非常重要。目前主要有以下几种土壤消毒剂。
溴甲烷 使用前清除残存秸秆及根系，深翻土壤至少30厘米，施好底肥，打碎大土块，保证土壤20厘米深处温度至少在8℃以上，温度越高，熏蒸作用越强。处理时搭小拱棚，棚膜要盖严。一般每亩用药40公斤，每13平方米放1罐药，药罐下垫一小块塑料布，施药时将药罐卡于开罐器上，隔着覆盖的棚膜，用力向下压罐，使开罐器的尖刃刺破罐，溴甲烷呈液态泻出于下垫的塑料布上，几分钟后气化。使用溴甲烷一定要谨慎，通风期间严禁农事操作，熏蒸期要达到15天左右，揭开薄膜通风30天以上才可种植。由于溴甲烷对病菌、杂草、线虫、昆虫和螨类等均有效，并且使用溴甲烷对黄瓜、番茄有明显的增产效果，目前使用较为广泛。
氰氨化钙 一般先将土杂粪撒入棚中，用旋耕机旋耕后将氰氨化钙均匀撒施在棚地上，然后再用旋耕机打匀，覆盖地膜，20~25天后揭膜。
欣诺华牌二氧化氯消毒剂 对土壤细菌，土传病害，根结线虫防治效果最好，使用方法，将二氧化氯活化后，加水稀释后，采用喷雾至湿润，渗入土壤大约5-6公分，保持30分钟。也可采用将二氧化氯消毒液随水浇灌土地，平时多用二氧化氯消毒剂可减少农药用量，防治多种页面病害，而且能降解重金属残留。具体使用方法咨询本公司技术人员。
三桥牌过氧乙酸消毒剂 过氧乙酸是强氧化剂，依靠其强大的杀毒机理，可杀灭所有的微生物及细菌，对植物细菌性侵害，真菌性病害，病毒病均有强烈的杀灭作用，因其分解产物是醋酸，水，氧气，长期使用不会造成残留和环境污染，使用方法有喷施，漫灌等，具体使用方法请咨询本公司技术人员。
