乳制品是富营养化物质，加工过程很容易受微生物污染，因此选择合适的消毒剂很重要。二氧化氯不仅杀菌消毒作用强于其它类消毒剂，而且不会破坏乳制品的营养成分，对人、动物无害。目前发达国家已将二氧化氯应用到几乎所有需要杀菌消毒的食品加工领域。
二氧化氯可以适用于牛奶、羊奶、马奶等液体乳类、还原奶（乳）、奶粉（乳粉）奶片、炼乳、乳脂肪、奶酪、干酪、乳冰激凌和干酪素、乳糖、乳清粉、浓缩乳清蛋白等其他乳制品类的加工制造过程的杀菌、消毒、保鲜。
【二氧化氯消毒剂在乳制品加工中的消毒方法】
1、调奶用水、生产用水的消毒：按照国家饮用水标准，投入二氧化氯消毒液投加浓度为0.5-1mg/L。
2、运输工具、进厂大门、进入车间处鞋靴池等的消毒：用100-200mg/L的二氧化氯消毒液浸泡、喷洒。
3、车间和冷库内部环境消毒：以1000mg/L二氧化氯消毒液熏蒸空气或100-200 mg/L的二氧化氯消毒液喷洒或擦拖。
4、管道、罐体等带CIP系统的消毒：以50-100mg/L的二氧化氯消毒液泵循环消毒15分钟以上或浸泡8小时过夜。
5、灌装机、灌装头、传送带等设备表面的消毒：用100mg/L的二氧化氯消毒液擦拭。
6、工作人员手、鞋靴、衣物、工具等物品消毒：清洗后，用30–100mg/L的二氧化氯消毒液浸泡。
【以下几个型号的二氧化氯适合在乳制品生产加工中使用】
1、 高纯二氧化氯消毒剂
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2、 稳定性二氧化氯溶液
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3、一元二氧化氯消毒粉
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