一、二氧化氯在甘蔗汁和甜菜汁（下面简称糖汁）过滤阶段的作用：
糖汁中主要的细菌――肠膜串珠菌以及放线菌能够产生孢子。多数细菌孢子的耐热性很强，在60～65℃下仍然存活。在100℃下大部分被杀死，但也有一部分未死亡，只是失去活性，停止活动。当温度降低到一定程度时，又再复活重新繁殖。因此，糖汁虽然在沉淀器中经受过长时间的高温，但在温度降低后，细菌孢子很快又会生长和恢复活动。
近年有些糖厂发现滤汁中有微生物繁殖，造成滤汁pH下降，纯度降低，有时发出酸臭的气味；在设备的死角处形成黑色膜状物，或白色的珠状团粒，严重时在泵出的滤汁中也有发现。在泥汁过滤时，如果滤汁清晰，其中的微生物不多；如果滤汁混浊，则大量的微生物随沉淀物进入滤汁中。在使用真空吸滤机过滤时，真空抽吸使糖汁部分自蒸发，温度降低。在其后的滤汁贮罐和管路中，滤汁中的微生物会重新繁殖，在设备和管路的死角位处积存发酵产物。一般来说，如果温度不低于75℃，糖汁中微生物的活动是不明显的；如果低于70℃，这种活动就较活跃，如果低于65℃，就会出现较大问题。
目前糖厂普遍采用无滤布真空吸滤机，其滤汁混浊，多数糖厂将它返回沉淀器。糖汁中微生物的反复循环会提高其耐热性，不良影响更大。在使用真空吸滤机时，在泥汁进口处加入浓度为5-8ppm的二氧化氯，可以大大降低滤汁中的细菌，还可以降低滤汁的色泽。 另外在助晶、分蜜阶段也可以加入少量二氧化氯，以保证细菌不在滋生，提高糖的结晶率，增加光泽改善质量。
二、工艺器具、设备、容器、生产线等的消毒：
蔗糠、甜菜粕中含有较多的微生物，积聚蔗糠、甜菜粕之处容易产生发酵等不良作用，糖汁中的糖、蛋白质等都是很好的营养物，很容易滋生细菌。澄清工段的很多设备中常有微生物活动，要认真重视搞好各项设备容器和车间内外的清洁，特别要注意防止在设备死角处形成“蔗饭”等细菌产物。可用50ppm浓度的二氧化氯对设备进行杀菌，效果很好。
在沉淀池内，细菌主要附着在沉淀物中。如果泥汁温度下降到75℃以下，其中的微生物会再次繁殖，使糖汁变酸，质量迅速下降。有些糖厂沉淀器中泥汁积存多，停留时间长，温度下降，泥汁pH值明显降低（如低至6.3甚至6.0以下），纯度也下降，微生物活动是重要的原因。要经常注意泥汁的状况，如果它的pH偏低或带黄色，就表示沉淀器内的泥汁中有细菌繁殖，要加快排出和清除。如果沉淀器排泥汁不畅顺或内部有死角，就容易发生这个问题。
榨汁机、沉淀器、沉淀池、生产线等的消毒用二氧化氯消毒剂替代氯制剂进行消毒，在杀菌的效果、安全性、腐蚀性、残留及气味的控制上都会有一个明显的提高。
具体的使用方法为：榨汁机、沉淀器、沉淀池、生产线等清洗干净后用50 mg/L的二氧化氯消毒剂浸泡5～10分钟或用50 -60ppm的二氧化氯消毒剂喷洒即可。消毒后无需冲洗即可使用。
三、使用方法：
将二氧化氯200g加入10kg水中，搅拌均匀，静置10分钟左右，参照下表稀释使用：
| 消毒对象 | 每袋加水（公斤） | 使用浓度ppm（mg/L） | 消毒时间 | 使用方法 |
| 榨汁机、沉淀器、沉淀池、生产线等消毒杀菌 | 260-330 | 50-60 | 10-15分钟 | 浸泡喷洒（自然干燥）擦拭 |
| 压榨、浸出汁过滤阶段 | 1600-2000（蔗汁、甜菜汁） | 5-8 | - | 投加搅拌或用计量泵均匀投加 |
| 助晶、分蜜阶段 | 1600-2000（汁） | 5-8 | - | 投加搅拌或用计量泵均匀投加 |
| 硫熏（漂）的取代阶段 | 1600-3200（汁） | 5-10 | - | 用计量泵均匀投加 |
| 生产环境如车间、贮藏室的空气消毒 | 160 | 100 | - | 喷雾 |
| 5 | 3000 | 2-8小时 | 自然熏蒸 | |
| 自来水、工业循环水消毒、除藻 | 16000-32000 | 1-0.5 | - | 直接投加 |
| 生产工艺水消毒 | 16000-5000 | 1-3 | - | 直接投加 |
| 手的消毒 | 160-200 | 80-100 | 1分钟 | 洗手液洗后用消毒液浸泡、自然干燥 |
| 工作服等的消毒 | 200-300 | 50-80 | 3-5分钟 | 洗净后浸泡、烘干或晾干 |
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